1、施用腐熟农家肥。大棚蔬菜施用农家肥时要充分腐熟，因为没有经过腐熟的农家肥存有病菌和虫卵，施用后，容易使病害得到传播。另外，如果将农家肥放到大棚里再进行腐熟，将会产生氨气烧伤菜苗。
2、施肥方法要科学合理。底肥最好在蔬菜定植一周前施用，并且要与土壤混合均匀。追肥可以在距离植株7—10厘米的地方沟施或者穴追，追肥后要及时盖土、浇水，千万不要将肥料直接撒在地面或植株上，以免肥料挥发或烧伤蔬菜秧苗。根外追肥应该在蔬菜需要肥料的高峰期及蔬菜生长后期，最好选择在阴天或傍晚的时候进行，尽量将肥液喷到新叶及叶子背面，以利于蔬菜吸收。
3、化肥施用要适量。大棚内的肥料不容易流失，过量施用化肥，能够引起土壤中盐类浓度增加，导致土壤的盐渍化。要控制氮肥，增施磷钾肥。需要禁止或限量施用的氮肥是硝态氮，如硝酸铵、硝酸钾、硝酸磷以及含硝态氮的复混肥。在大棚蔬菜管理上，增加通风时间，增强光照强度，可减少蔬菜硝酸盐的含量。不宜施含氯化肥，如氯化钾、氯化铵等。氯离子能降低蔬菜中的淀粉含量，使品质变劣，而且残留于土壤中易造成土壤板结。
4、科学施用微肥。微量元素肥料在蔬菜上需求量虽然很小，但它在蔬菜代谢中的作用却是很大的，能大大提升蔬菜品质。目前常用的微肥有硼、钼、锌、铁肥等。微肥多做基肥施用，也可以用于拌种、浸种或根外追肥。微肥适量与过量之间的范围比较窄，所以用量一定要准确，避免造成肥害。
5、控制好植物生长调节剂的浓度。使用好植物生长调节剂（如赤霉素、乙烯利、多效唑等），会对蔬菜增产起到促进作用，但是每种调节剂在应用上都有一定的条件和范围，尤其要掌握好使用的时间和浓度，否则不但不能达到蔬菜增产的效果，而且人们长久食用也会对身体健康不利。
6、大力推广生物有机复合肥料。生物肥料含有微生物活化菌，它是由有机肥、无机肥、菌肥、增效剂复合而成的“四合一”肥料，实现了各种肥料的科学配方，优势互补，效益互促，是实现大棚蔬菜平衡施肥的最佳肥料之一。
7、尽量施用蔬菜专用性肥料。在实施配方施肥的前提下，推广蔬菜专用型复合肥料。专用性肥料是根据不同蔬菜的需肥特点和土壤供肥状况而研制确定的，养分更齐全，营养更科学，配方更合理，针对性更强，施用后能显著提高大棚蔬菜产量和品质。
8、增施钾肥提高产量。瓜类和茄果类蔬菜施用钾肥有明显的增产效果，这是因为随着大棚蔬菜连年偏施氮磷类化肥，致使土壤供钾能力随着种植年限的增长及蔬菜产量的提高而逐渐减弱。据试验，大棚黄瓜667平方米补施氧化钾7.5千克，表现出茎秆粗壮，叶片鲜绿肥厚，瓜条顺直，产量和品质都有明显提高。应注意的是，选用钾肥品种时最好不用氯化钾，以免土壤盐渍化。
