隔离检疫温室的环境参数必须是可控的，可以根据需要自动调节。其调节参数范围和精度如下：
1、隔离检疫温室进风口、出风口及正负压的实现
隔离检疫温室按照工作性质的不同可以实现正压环境、负压环境及常压环境。压力的控制是在温室密闭的前提下，通过改变进出风量而实现的。 为防止昆虫、花粉、孢子等从通风口进出隔离温室，隔离间的进出风口安装严格的控制部件，以保证达到检疫或科研工作的要求。
进风口。
进风口内设有变频调速风机一台， 过滤层分3层。风口最外层是铁丝网格，也可做成百叶窗式样的，其作用是防止异物进入。次外层作用是防止微小颗粒，里层是超微过滤层，防止花粉、昆虫和饱子等微生物进入。
出风口。
出风口内设有变频调速风机一台，最上层是防雨罩，出风口的过滤层同样要23层，最外一层是网纱防护层，防止异物进入，内层是过滤层，最里一层为超过滤层。防止隔离温室内部有害微生物排出到室外。
隔离检疫温室间正负压的实现。
对一个密闭空间而言，进风量大于出风量时，室内就形成正压； 反之，进风量小于出风量时，室内就形成负压。隔离 疫温室正是通过调节进出风口的风量来控制温室隔离的压力，而进出风量又依靠计算机自动控制来实现的。隔离温室的压差可按工作要求而设定，通常控制在±（5-20）Pa之间。考虑到一些特殊的检疫要求，可在温室的进出风口加装消毒设备(如紫外线消毒杀菌装置、高温处理装置等）。
2、杀菌消毒系统
各隔离间有着不同的作业任务，工作环境也不相同。为了防止互相干扰，工作人员进人每一隔离温室间时，必须首先进入温室通道，然后才能逐一进入隔离间工作。温室通道的入口还设有缓冲隔离间。在整个隔离温室区，缓冲间内、外各设一道带有密码锁的门，这两个门的设置为特殊的，进门时，除要输入设定的密码外，还要待两个门同时处于关闭状态时才能打开其中一个门。工作人员进人通道的第一道门后，该门必须关闭后方能打开第二道门。 同理，若外出时，必须打开里面的门，进入缓冲间且关闭里面的门后，才能打开门出去。在缓冲间还设有警报装置，若某一道门开放时间过长，警报器会自动报警提示关门。
在缓冲间内安装了空气消毒净化机，它是一部科技含量很高的新型环保产品。它的电极内部产生的“空气放电等离子体”迅速穿透细菌细胞致其死亡，等离子体形成过程中，亦可释放出大量紫外线，等离子体紫外线中有80℃以上在具有杀菌作用的波长。因此，紫外线在等离子体杀菌中也发挥着重要作用。
在隔离温室进口处还设置了风淋室、配备消毒脚垫，对进出入人员进行脚下消毒。用于植物基因研究的温室隔离间，除第1个缓冲间外，在进人温室通道后还增设了第2缓冲间。
3、空调系统及计算机自动控制系统
①、空调系统。根据工程所处地理位置，室外计算参数按《采暖通风与空气调节设计规范》中标准气象参数选用，然后依据隔离温室的规格和覆盖材料可以计算出所需要的冷负荷。为了精确地控制温室的温度、湿度，温室内配备空调设施，一般可以采用空调机组或分体式空调装置，空调机组成本高、运行费高、精度高，分体式空调成本低、运行费低、精度低，用户可以根据实际需要加以选择。
②、检疫温室中的自动控制系统。一般在温室的每一个隔离间均设有温度、湿度、气压、光照的传感 器，信号通过电缆上传给计算机，计算机就可在设定的工作范围内进行控制。根据具体工作的要求可对环境的温度、湿度、气压、光照进行自动调控。条件许可的情况下，可以配置视频监控系统，有利于管理者更加直观了解隔离温室内作物生长情况。控制系统可靠、安全，人机界面友好、操作方便。
4、隔离间废弃物处理
①、废水处理 检疫及相关研究过程中产生的废水，由于可能含有病原或虫卵等，是不允许随意排放的。根据不同的情况，对隔离温室中产生的废水，一般采取以下 2种处理方法:第一是针对工作中产生的大量废水的处理，具体做法是在隔离温室内建立独立的废水回收处理循环系统，将工作中产生的废水集中收集后，通过专用密封管路泵入消毒罐，然后加热消毒处理，杀死有害生物，过滤后经过水泵回到隔离温室循环使用;其二是对检疫过程中产生少量废水的处理， 一般是将检疫过程中产生的少量废水集中收集，经消毒处理后，在隔离温室内自然蒸发。
②、检疫过程中固形物的处理 经检疫的农作物植株、种块等是各种检疫性有 害生物的载体，检疫过后必须及时处理。处理的过程中产生的固形废弃物、残渣、皮屑等垃圾要集中包装，并通过专用通道集中运输，最终送到焚烧炉或高温消毒（135℃）长时间处理。
