(1) 土壤表层盐分浓度高
温室具有半封闭的特点，不存在自然降雨对土壤的淋浴作用，因此土壤中积累的盐分难以移动到地下水中。另一方面，温室内作物生长旺盛，土壤蒸发和作物蒸腾作用都比露地强，因此盐分在作物根系吸水的过程中被水带至土壤表层进一步加重了盐分的积累。
(2) 土壤有机质含量高
温室或者蔬菜大棚内土壤有机质含量（包括有机质总量和可氧化的有机质含量）高，土壤腐殖质含量高，有利于作物生长。
(3) 土壤酸化
温室或者蔬菜大棚种植茬数多，氮肥施用量过大时会引起土壤酸化，土壤酸化除直接危害作物外还影响作物对营养元素的吸收。
(4)连作障碍
温室或者蔬菜大棚内栽培品种比较单一，往往不注意轮作换茬。这种栽培方式容易造成土壤中养分的不平衡，有些营养元素亏缺，有些又残留富积，产生连作障碍。
(5) 土壤生物环境特点
温室或者蔬菜大棚内土壤含湿量较高，这种湿润环境利于微生物的活动，可能给作物生长带来有利的一面。与此同时，土传病及虫害也更易于传播和发展，使得一些在露地不难消灭的病虫害在温室内很难绝迹。
